2001年1月，北京大學與深圳市人民政府簽署《合作創(chuàng)辦北京大學深圳校區(qū)協(xié)議書》，共同創(chuàng)辦北京大學深圳研究生院。經(jīng)過十七年發(fā)展，深圳研究生院依托北大、立足深圳，逐步成為扎根深圳的北京大學研究型國際化校區(qū)，北京大學創(chuàng)建世界大學戰(zhàn)略的重要組成部分。

秉承北京大學“愛國、進步、民主、科學”的光榮傳統(tǒng)；“思想自由，兼容并包”的學術精神，“勤奮、嚴謹、求實、創(chuàng)新”的優(yōu)良學風，融合深圳創(chuàng)新、創(chuàng)業(yè)，不斷改革的城市文化，逐步形成了深研院的辦學原則、方針和培養(yǎng)目標：

發(fā)展原則：與校本部差異化發(fā)展，學科互補；面向深圳，服務廣東，輻射華南，為地方經(jīng)濟發(fā)展服務

辦學方針：前沿領域、交叉學科、應用學術、 國際標準

培養(yǎng)目標：專業(yè)知識、綜合素質(zhì)、國際視野、社會責任